Analizę cen transferowych prowadzić należy metodą „top-down”, tj. od ogólnych kwestii do kwestii coraz bardziej szczegółowych. Jest to zgodne z zaleceniami OECD. Takie podejście jest o tyle istotne, że różne przedsiębiorstwa działające w różnych branżach charakteryzują się różnymi modelami biznesowymi i pełnionymi funkcjami. Jednocześnie władze podatkowe prezentują raczej jednolite (i konserwatywne) podejście do modeli biznesowych. Tym samym to na przedsiębiorstwie ciąży zadanie efektywnego wyjaśnienia tego, w jakim kontekście biznesowym działa.